Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms