Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC4Q92889 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC4Q92889 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC4Q92889 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC4Q92889 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC4Q92889 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC4Q92889 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC4Q92889 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC4Q92889 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC4Q92889 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC4Q92889 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERCC4Q92889 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms