Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms