Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LMO7Q8WWI1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMO7Q8WWI1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMO7Q8WWI1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMO7Q8WWI1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMO7Q8WWI1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMO7Q8WWI1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMO7Q8WWI1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LMO7Q8WWI1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMO7Q8WWI1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMO7Q8WWI1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMO7Q8WWI1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMO7Q8WWI1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMO7Q8WWI1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMO7Q8WWI1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMO7Q8WWI1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMO7Q8WWI1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMO7Q8WWI1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMO7Q8WWI1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMO7Q8WWI1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMO7Q8WWI1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMO7Q8WWI1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms