Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW18

C17orf50, Uncharacterized protein C17orf50, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf50Q8WW18 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf50Q8WW18 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf50Q8WW18 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms