Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC148Q8NFR7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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