Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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