Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms