Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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DTX3Q8N9I9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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