Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms