Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1W1

ARHGEF28, Rho guanine nucleotide exchange factor 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF28Q8N1W1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
ARHGEF28Q8N1W1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGEF28Q8N1W1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
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