Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1B3

FAM58A, Cyclin-related protein FAM58A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58AQ8N1B3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM58AQ8N1B3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms