Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ96

CMTM1, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1Q8IZ96 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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