Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms