Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms