Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSSK4Q6SA08 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TSSK4Q6SA08 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSSK4Q6SA08 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSSK4Q6SA08 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSSK4Q6SA08 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSSK4Q6SA08 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSSK4Q6SA08 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSSK4Q6SA08 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSSK4Q6SA08 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSSK4Q6SA08 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSSK4Q6SA08 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSSK4Q6SA08 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSSK4Q6SA08 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TSSK4Q6SA08 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSSK4Q6SA08 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSSK4Q6SA08 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSSK4Q6SA08 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSSK4Q6SA08 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSSK4Q6SA08 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSSK4Q6SA08 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSSK4Q6SA08 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSSK4Q6SA08 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSSK4Q6SA08 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSSK4Q6SA08 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSSK4Q6SA08 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSSK4Q6SA08 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms