Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms