Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms