Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms