Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
REEP3Q6NUK4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms