Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms