Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms