Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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GFI1BQ5VTD9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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GFI1BQ5VTD9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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GFI1BQ5VTD9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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GFI1BQ5VTD9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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GFI1BQ5VTD9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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GFI1BQ5VTD9 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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GFI1BQ5VTD9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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GFI1BQ5VTD9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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GFI1BQ5VTD9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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