Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PRAMEF20Q5VT98 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF20Q5VT98 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF20Q5VT98 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF20Q5VT98 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF20Q5VT98 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF20Q5VT98 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF20Q5VT98 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF20Q5VT98 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF20Q5VT98 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF20Q5VT98 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF20Q5VT98 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF20Q5VT98 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF20Q5VT98 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF20Q5VT98 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF20Q5VT98 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF20Q5VT98 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF20Q5VT98 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF20Q5VT98 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF20Q5VT98 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF20Q5VT98 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF20Q5VT98 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF20Q5VT98 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF20Q5VT98 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms