Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYT6Q5T7P8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYT6Q5T7P8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYT6Q5T7P8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYT6Q5T7P8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYT6Q5T7P8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYT6Q5T7P8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYT6Q5T7P8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYT6Q5T7P8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYT6Q5T7P8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYT6Q5T7P8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYT6Q5T7P8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYT6Q5T7P8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYT6Q5T7P8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYT6Q5T7P8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYT6Q5T7P8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYT6Q5T7P8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYT6Q5T7P8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYT6Q5T7P8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYT6Q5T7P8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYT6Q5T7P8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYT6Q5T7P8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYT6Q5T7P8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYT6Q5T7P8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYT6Q5T7P8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYT6Q5T7P8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYT6Q5T7P8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYT6Q5T7P8 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYT6Q5T7P8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYT6Q5T7P8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYT6Q5T7P8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYT6Q5T7P8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SYT6Q5T7P8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SYT6Q5T7P8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SYT6Q5T7P8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SYT6Q5T7P8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYT6Q5T7P8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms