Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms