Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms