Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC9

AKAP4, A-kinase anchor protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP4Q5JQC9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AKAP4Q5JQC9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms