Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAN3Q58A45 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms