Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms