Protein–RNA interactions for Protein: Q569G3

C5orf47, Uncharacterized protein C5orf47, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf47Q569G3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms