Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms