Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC23Q53EV4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRC23Q53EV4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRC23Q53EV4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRC23Q53EV4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRC23Q53EV4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRC23Q53EV4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRC23Q53EV4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRC23Q53EV4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRC23Q53EV4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRC23Q53EV4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRC23Q53EV4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRC23Q53EV4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRC23Q53EV4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC23Q53EV4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC23Q53EV4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC23Q53EV4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC23Q53EV4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC23Q53EV4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC23Q53EV4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC23Q53EV4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC23Q53EV4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC23Q53EV4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC23Q53EV4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC23Q53EV4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC23Q53EV4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC23Q53EV4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC23Q53EV4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC23Q53EV4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC23Q53EV4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC23Q53EV4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC23Q53EV4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms