Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPRNQ4KMQ1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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