Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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