Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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