Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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