Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
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