Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FRMPD4Q14CM0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD4Q14CM0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD4Q14CM0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD4Q14CM0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD4Q14CM0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD4Q14CM0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD4Q14CM0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD4Q14CM0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD4Q14CM0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD4Q14CM0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD4Q14CM0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD4Q14CM0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD4Q14CM0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD4Q14CM0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD4Q14CM0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD4Q14CM0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD4Q14CM0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD4Q14CM0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD4Q14CM0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD4Q14CM0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD4Q14CM0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD4Q14CM0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD4Q14CM0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD4Q14CM0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD4Q14CM0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD4Q14CM0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD4Q14CM0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD4Q14CM0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD4Q14CM0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD4Q14CM0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD4Q14CM0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD4Q14CM0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD4Q14CM0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms