Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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