Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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KCNC3Q14003 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
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KCNC3Q14003 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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KCNC3Q14003 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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KCNC3Q14003 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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KCNC3Q14003 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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KCNC3Q14003 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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KCNC3Q14003 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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KCNC3Q14003 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNC3Q14003 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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