Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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