Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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