Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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