Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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