Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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FOXE3Q13461 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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FOXE3Q13461 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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FOXE3Q13461 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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FOXE3Q13461 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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FOXE3Q13461 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FOXE3Q13461 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FOXE3Q13461 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FOXE3Q13461 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FOXE3Q13461 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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