Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
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