Protein–RNA interactions for Protein: Q13233

MAP3K1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K1Q13233 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
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MAP3K1Q13233 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
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MAP3K1Q13233 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
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MAP3K1Q13233 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
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MAP3K1Q13233 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
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MAP3K1Q13233 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
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MAP3K1Q13233 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
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MAP3K1Q13233 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MAP3K1Q13233 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MAP3K1Q13233 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MAP3K1Q13233 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MAP3K1Q13233 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MAP3K1Q13233 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
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MAP3K1Q13233 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
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MAP3K1Q13233 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
MAP3K1Q13233 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MAP3K1Q13233 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MAP3K1Q13233 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MAP3K1Q13233 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MAP3K1Q13233 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MAP3K1Q13233 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MAP3K1Q13233 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MAP3K1Q13233 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MAP3K1Q13233 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MAP3K1Q13233 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MAP3K1Q13233 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MAP3K1Q13233 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
MAP3K1Q13233 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
MAP3K1Q13233 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
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