Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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