Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
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